Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHI3L1P36222 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHI3L1P36222 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms