Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR7P32248 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR7P32248 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR7P32248 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR7P32248 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCR7P32248 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR7P32248 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR7P32248 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR7P32248 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR7P32248 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR7P32248 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR7P32248 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR7P32248 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR7P32248 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR7P32248 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR7P32248 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR7P32248 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR7P32248 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR7P32248 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR7P32248 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR7P32248 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR7P32248 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR7P32248 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR7P32248 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR7P32248 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR7P32248 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR7P32248 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR7P32248 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR7P32248 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR7P32248 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR7P32248 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR7P32248 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR7P32248 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR7P32248 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR7P32248 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR7P32248 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR7P32248 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR7P32248 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR7P32248 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR7P32248 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR7P32248 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR7P32248 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR7P32248 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR7P32248 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR7P32248 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR7P32248 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR7P32248 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR7P32248 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR7P32248 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR7P32248 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR7P32248 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR7P32248 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR7P32248 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR7P32248 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR7P32248 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR7P32248 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR7P32248 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR7P32248 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR7P32248 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR7P32248 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR7P32248 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR7P32248 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR7P32248 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCR7P32248 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCR7P32248 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCR7P32248 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR7P32248 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR7P32248 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR7P32248 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR7P32248 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR7P32248 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR7P32248 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR7P32248 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR7P32248 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR7P32248 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR7P32248 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR7P32248 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR7P32248 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR7P32248 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR7P32248 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR7P32248 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR7P32248 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR7P32248 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR7P32248 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR7P32248 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR7P32248 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR7P32248 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR7P32248 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR7P32248 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR7P32248 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR7P32248 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR7P32248 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR7P32248 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR7P32248 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR7P32248 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR7P32248 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR7P32248 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR7P32248 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCR7P32248 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCR7P32248 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms