Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA6P31267 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA6P31267 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA6P31267 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms