Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA3P29320 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPHA3P29320 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA3P29320 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms