Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP1P28562 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms