Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD10P28358 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD10P28358 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms