Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMA5P28066 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMA5P28066 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMA5P28066 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMA5P28066 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms