Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GADD45AP24522 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GADD45AP24522 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms