Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA4P22748 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA4P22748 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA4P22748 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA4P22748 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA4P22748 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA4P22748 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA4P22748 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA4P22748 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA4P22748 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA4P22748 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA4P22748 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA4P22748 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA4P22748 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA4P22748 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA4P22748 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA4P22748 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA4P22748 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA4P22748 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA4P22748 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA4P22748 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CA4P22748 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CA4P22748 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CA4P22748 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CA4P22748 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CA4P22748 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CA4P22748 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CA4P22748 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA4P22748 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA4P22748 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA4P22748 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA4P22748 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA4P22748 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA4P22748 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA4P22748 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA4P22748 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA4P22748 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CA4P22748 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CA4P22748 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CA4P22748 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA4P22748 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA4P22748 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA4P22748 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA4P22748 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA4P22748 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CA4P22748 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA4P22748 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA4P22748 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA4P22748 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA4P22748 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA4P22748 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA4P22748 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA4P22748 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA4P22748 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CA4P22748 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA4P22748 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA4P22748 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA4P22748 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA4P22748 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CA4P22748 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CA4P22748 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CA4P22748 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CA4P22748 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CA4P22748 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CA4P22748 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA4P22748 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA4P22748 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA4P22748 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CA4P22748 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CA4P22748 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CA4P22748 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CA4P22748 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CA4P22748 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CA4P22748 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CA4P22748 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CA4P22748 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CA4P22748 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CA4P22748 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA4P22748 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA4P22748 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA4P22748 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA4P22748 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CA4P22748 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA4P22748 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA4P22748 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA4P22748 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CA4P22748 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CA4P22748 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CA4P22748 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CA4P22748 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CA4P22748 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CA4P22748 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CA4P22748 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CA4P22748 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CA4P22748 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CA4P22748 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CA4P22748 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CA4P22748 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CA4P22748 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CA4P22748 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms