Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS4Y1P22090 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS4Y1P22090 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms