Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASTP20810 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASTP20810 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASTP20810 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASTP20810 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASTP20810 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASTP20810 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASTP20810 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASTP20810 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASTP20810 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASTP20810 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASTP20810 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CASTP20810 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASTP20810 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASTP20810 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASTP20810 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASTP20810 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASTP20810 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASTP20810 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASTP20810 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASTP20810 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASTP20810 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASTP20810 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASTP20810 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASTP20810 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASTP20810 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASTP20810 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASTP20810 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASTP20810 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CASTP20810 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CASTP20810 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASTP20810 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASTP20810 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASTP20810 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CASTP20810 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASTP20810 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASTP20810 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASTP20810 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASTP20810 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASTP20810 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASTP20810 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASTP20810 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASTP20810 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASTP20810 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASTP20810 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASTP20810 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASTP20810 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASTP20810 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASTP20810 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASTP20810 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASTP20810 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASTP20810 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASTP20810 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASTP20810 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASTP20810 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CASTP20810 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASTP20810 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASTP20810 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASTP20810 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASTP20810 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASTP20810 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASTP20810 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASTP20810 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASTP20810 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASTP20810 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASTP20810 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASTP20810 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASTP20810 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASTP20810 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASTP20810 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASTP20810 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASTP20810 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASTP20810 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASTP20810 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASTP20810 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASTP20810 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASTP20810 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASTP20810 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASTP20810 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASTP20810 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASTP20810 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASTP20810 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASTP20810 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASTP20810 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASTP20810 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CASTP20810 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASTP20810 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CASTP20810 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASTP20810 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CASTP20810 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASTP20810 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASTP20810 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASTP20810 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASTP20810 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASTP20810 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASTP20810 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASTP20810 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASTP20810 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASTP20810 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASTP20810 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms