Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNNI3P19429 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI3P19429 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI3P19429 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms