Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNRPBP14678 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNRPBP14678 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNRPBP14678 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms