Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FCER1AP12319 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FCER1AP12319 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FCER1AP12319 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms