Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRBP10828 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRBP10828 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRBP10828 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRBP10828 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRBP10828 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRBP10828 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRBP10828 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRBP10828 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRBP10828 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRBP10828 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRBP10828 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRBP10828 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRBP10828 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRBP10828 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRBP10828 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRBP10828 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRBP10828 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRBP10828 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRBP10828 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRBP10828 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
THRBP10828 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRBP10828 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRBP10828 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRBP10828 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THRBP10828 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THRBP10828 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THRBP10828 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THRBP10828 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THRBP10828 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THRBP10828 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THRBP10828 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THRBP10828 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THRBP10828 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THRBP10828 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THRBP10828 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THRBP10828 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRBP10828 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRBP10828 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRBP10828 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRBP10828 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRBP10828 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRBP10828 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRBP10828 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THRBP10828 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THRBP10828 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRBP10828 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRBP10828 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRBP10828 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRBP10828 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THRBP10828 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRBP10828 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THRBP10828 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRBP10828 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRBP10828 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRBP10828 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRBP10828 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THRBP10828 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRBP10828 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRBP10828 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRBP10828 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THRBP10828 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THRBP10828 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THRBP10828 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRBP10828 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRBP10828 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRBP10828 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRBP10828 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRBP10828 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
THRBP10828 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRBP10828 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRBP10828 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRBP10828 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRBP10828 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRBP10828 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRBP10828 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRBP10828 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRBP10828 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRBP10828 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRBP10828 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRBP10828 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRBP10828 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
THRBP10828 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRBP10828 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRBP10828 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRBP10828 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRBP10828 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms