Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GLI3P10071 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GLI3P10071 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
GLI3P10071 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GLI3P10071 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GLI3P10071 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GLI3P10071 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GLI3P10071 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GLI3P10071 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GLI3P10071 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GLI3P10071 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GLI3P10071 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GLI3P10071 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GLI3P10071 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GLI3P10071 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
GLI3P10071 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
GLI3P10071 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GLI3P10071 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GLI3P10071 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GLI3P10071 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GLI3P10071 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GLI3P10071 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GLI3P10071 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GLI3P10071 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GLI3P10071 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GLI3P10071 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
GLI3P10071 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GLI3P10071 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GLI3P10071 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GLI3P10071 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GLI3P10071 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GLI3P10071 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GLI3P10071 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GLI3P10071 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GLI3P10071 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GLI3P10071 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GLI3P10071 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GLI3P10071 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
GLI3P10071 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GLI3P10071 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GLI3P10071 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GLI3P10071 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GLI3P10071 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GLI3P10071 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GLI3P10071 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GLI3P10071 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GLI3P10071 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GLI3P10071 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GLI3P10071 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GLI3P10071 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GLI3P10071 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GLI3P10071 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GLI3P10071 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GLI3P10071 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GLI3P10071 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GLI3P10071 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GLI3P10071 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GLI3P10071 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GLI3P10071 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
GLI3P10071 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GLI3P10071 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
GLI3P10071 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
GLI3P10071 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GLI3P10071 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GLI3P10071 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
GLI3P10071 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GLI3P10071 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GLI3P10071 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GLI3P10071 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GLI3P10071 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GLI3P10071 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GLI3P10071 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GLI3P10071 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GLI3P10071 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GLI3P10071 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
GLI3P10071 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GLI3P10071 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GLI3P10071 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GLI3P10071 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
GLI3P10071 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
GLI3P10071 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GLI3P10071 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GLI3P10071 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
GLI3P10071 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GLI3P10071 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GLI3P10071 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GLI3P10071 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GLI3P10071 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GLI3P10071 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GLI3P10071 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI3P10071 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI3P10071 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI3P10071 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI3P10071 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI3P10071 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI3P10071 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI3P10071 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI3P10071 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI3P10071 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI3P10071 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms