Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM225BP0DP42 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms