Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD48P09326 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD48P09326 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD48P09326 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD48P09326 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CD48P09326 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CD48P09326 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD48P09326 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD48P09326 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD48P09326 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD48P09326 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD48P09326 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD48P09326 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD48P09326 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD48P09326 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD48P09326 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD48P09326 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD48P09326 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD48P09326 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD48P09326 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD48P09326 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD48P09326 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD48P09326 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD48P09326 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD48P09326 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CD48P09326 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD48P09326 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD48P09326 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD48P09326 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD48P09326 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD48P09326 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD48P09326 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD48P09326 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD48P09326 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD48P09326 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD48P09326 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD48P09326 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD48P09326 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD48P09326 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD48P09326 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD48P09326 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD48P09326 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD48P09326 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD48P09326 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD48P09326 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD48P09326 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD48P09326 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD48P09326 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD48P09326 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD48P09326 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD48P09326 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD48P09326 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD48P09326 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD48P09326 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD48P09326 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD48P09326 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD48P09326 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD48P09326 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD48P09326 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD48P09326 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD48P09326 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD48P09326 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD48P09326 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD48P09326 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD48P09326 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD48P09326 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD48P09326 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD48P09326 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD48P09326 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD48P09326 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD48P09326 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD48P09326 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD48P09326 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD48P09326 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CD48P09326 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD48P09326 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD48P09326 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD48P09326 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CD48P09326 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD48P09326 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD48P09326 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD48P09326 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD48P09326 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD48P09326 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CD48P09326 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD48P09326 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CD48P09326 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD48P09326 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD48P09326 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD48P09326 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD48P09326 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD48P09326 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD48P09326 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD48P09326 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CD48P09326 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD48P09326 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD48P09326 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD48P09326 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD48P09326 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD48P09326 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms