Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFRP08138 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFRP08138 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFRP08138 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFRP08138 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFRP08138 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFRP08138 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFRP08138 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFRP08138 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NGFRP08138 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NGFRP08138 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NGFRP08138 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NGFRP08138 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NGFRP08138 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NGFRP08138 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NGFRP08138 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NGFRP08138 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NGFRP08138 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NGFRP08138 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NGFRP08138 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NGFRP08138 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NGFRP08138 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NGFRP08138 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NGFRP08138 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NGFRP08138 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NGFRP08138 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NGFRP08138 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NGFRP08138 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NGFRP08138 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NGFRP08138 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NGFRP08138 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NGFRP08138 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NGFRP08138 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NGFRP08138 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGFRP08138 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGFRP08138 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGFRP08138 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGFRP08138 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGFRP08138 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGFRP08138 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGFRP08138 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGFRP08138 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGFRP08138 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGFRP08138 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGFRP08138 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGFRP08138 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGFRP08138 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGFRP08138 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NGFRP08138 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGFRP08138 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGFRP08138 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGFRP08138 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGFRP08138 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGFRP08138 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGFRP08138 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGFRP08138 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGFRP08138 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFRP08138 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFRP08138 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFRP08138 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFRP08138 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NGFRP08138 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGFRP08138 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGFRP08138 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGFRP08138 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGFRP08138 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NGFRP08138 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGFRP08138 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGFRP08138 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGFRP08138 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGFRP08138 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NGFRP08138 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NGFRP08138 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGFRP08138 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFRP08138 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFRP08138 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFRP08138 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFRP08138 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFRP08138 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFRP08138 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFRP08138 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFRP08138 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGFRP08138 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGFRP08138 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NGFRP08138 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGFRP08138 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGFRP08138 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGFRP08138 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGFRP08138 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGFRP08138 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGFRP08138 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGFRP08138 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGFRP08138 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGFRP08138 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFRP08138 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFRP08138 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFRP08138 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFRP08138 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFRP08138 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFRP08138 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms