Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPN1P04843 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPN1P04843 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPN1P04843 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPN1P04843 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPN1P04843 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPN1P04843 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPN1P04843 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPN1P04843 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPN1P04843 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPN1P04843 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPN1P04843 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPN1P04843 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPN1P04843 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPN1P04843 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RPN1P04843 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPN1P04843 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPN1P04843 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPN1P04843 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RPN1P04843 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPN1P04843 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RPN1P04843 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPN1P04843 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPN1P04843 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPN1P04843 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPN1P04843 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPN1P04843 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPN1P04843 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPN1P04843 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPN1P04843 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RPN1P04843 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPN1P04843 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPN1P04843 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPN1P04843 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPN1P04843 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPN1P04843 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPN1P04843 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPN1P04843 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPN1P04843 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPN1P04843 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPN1P04843 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPN1P04843 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPN1P04843 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPN1P04843 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPN1P04843 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPN1P04843 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPN1P04843 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPN1P04843 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPN1P04843 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPN1P04843 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPN1P04843 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPN1P04843 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPN1P04843 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPN1P04843 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPN1P04843 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPN1P04843 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPN1P04843 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPN1P04843 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPN1P04843 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPN1P04843 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPN1P04843 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPN1P04843 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPN1P04843 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPN1P04843 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPN1P04843 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPN1P04843 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPN1P04843 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPN1P04843 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPN1P04843 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPN1P04843 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPN1P04843 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPN1P04843 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPN1P04843 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPN1P04843 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPN1P04843 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPN1P04843 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPN1P04843 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPN1P04843 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPN1P04843 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPN1P04843 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPN1P04843 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPN1P04843 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPN1P04843 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPN1P04843 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPN1P04843 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPN1P04843 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms