Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV3-11P04433 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV3-11P04433 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms