Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRNPP04156 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRNPP04156 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRNPP04156 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRNPP04156 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRNPP04156 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRNPP04156 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRNPP04156 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRNPP04156 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRNPP04156 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRNPP04156 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRNPP04156 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRNPP04156 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRNPP04156 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRNPP04156 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRNPP04156 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRNPP04156 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRNPP04156 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRNPP04156 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRNPP04156 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRNPP04156 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRNPP04156 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRNPP04156 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRNPP04156 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRNPP04156 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRNPP04156 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRNPP04156 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRNPP04156 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRNPP04156 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRNPP04156 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRNPP04156 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRNPP04156 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRNPP04156 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRNPP04156 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRNPP04156 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRNPP04156 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRNPP04156 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRNPP04156 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRNPP04156 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRNPP04156 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRNPP04156 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRNPP04156 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRNPP04156 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRNPP04156 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRNPP04156 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRNPP04156 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRNPP04156 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRNPP04156 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRNPP04156 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRNPP04156 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRNPP04156 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRNPP04156 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRNPP04156 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRNPP04156 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRNPP04156 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRNPP04156 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRNPP04156 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRNPP04156 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRNPP04156 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRNPP04156 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRNPP04156 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRNPP04156 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRNPP04156 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRNPP04156 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRNPP04156 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRNPP04156 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRNPP04156 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRNPP04156 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRNPP04156 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRNPP04156 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRNPP04156 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRNPP04156 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRNPP04156 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRNPP04156 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRNPP04156 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRNPP04156 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRNPP04156 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRNPP04156 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRNPP04156 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRNPP04156 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRNPP04156 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRNPP04156 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRNPP04156 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRNPP04156 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRNPP04156 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRNPP04156 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRNPP04156 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRNPP04156 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRNPP04156 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms