Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND1P03886 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND1P03886 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND1P03886 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms