Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GCP02774 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GCP02774 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
GCP02774 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GCP02774 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GCP02774 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GCP02774 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GCP02774 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GCP02774 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GCP02774 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GCP02774 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GCP02774 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
GCP02774 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GCP02774 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GCP02774 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GCP02774 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GCP02774 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GCP02774 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GCP02774 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GCP02774 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GCP02774 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GCP02774 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
GCP02774 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GCP02774 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
GCP02774 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GCP02774 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GCP02774 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GCP02774 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GCP02774 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GCP02774 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GCP02774 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GCP02774 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GCP02774 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GCP02774 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GCP02774 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GCP02774 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GCP02774 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GCP02774 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GCP02774 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GCP02774 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GCP02774 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GCP02774 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GCP02774 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GCP02774 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GCP02774 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GCP02774 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GCP02774 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GCP02774 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
GCP02774 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GCP02774 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GCP02774 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GCP02774 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GCP02774 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GCP02774 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GCP02774 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GCP02774 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GCP02774 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GCP02774 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GCP02774 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
GCP02774 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GCP02774 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GCP02774 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCP02774 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCP02774 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCP02774 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCP02774 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCP02774 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GCP02774 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GCP02774 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GCP02774 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GCP02774 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
GCP02774 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GCP02774 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GCP02774 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GCP02774 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GCP02774 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GCP02774 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GCP02774 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GCP02774 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GCP02774 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GCP02774 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GCP02774 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GCP02774 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
GCP02774 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
GCP02774 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GCP02774 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GCP02774 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GCP02774 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GCP02774 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GCP02774 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GCP02774 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GCP02774 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GCP02774 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GCP02774 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GCP02774 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GCP02774 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GCP02774 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GCP02774 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GCP02774 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GCP02774 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms