Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VIPP01282 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VIPP01282 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIPP01282 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIPP01282 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIPP01282 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VIPP01282 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VIPP01282 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIPP01282 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIPP01282 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPP01282 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPP01282 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPP01282 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPP01282 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPP01282 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPP01282 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPP01282 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPP01282 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPP01282 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPP01282 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPP01282 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VIPP01282 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPP01282 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPP01282 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPP01282 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPP01282 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPP01282 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPP01282 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPP01282 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPP01282 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPP01282 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPP01282 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIPP01282 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIPP01282 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIPP01282 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIPP01282 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIPP01282 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPP01282 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPP01282 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPP01282 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPP01282 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPP01282 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPP01282 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPP01282 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPP01282 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPP01282 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPP01282 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPP01282 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPP01282 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPP01282 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPP01282 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPP01282 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPP01282 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPP01282 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
VIPP01282 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPP01282 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPP01282 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPP01282 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPP01282 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPP01282 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPP01282 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPP01282 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPP01282 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPP01282 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPP01282 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPP01282 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPP01282 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPP01282 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPP01282 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPP01282 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPP01282 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPP01282 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPP01282 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPP01282 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPP01282 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPP01282 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPP01282 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPP01282 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPP01282 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPP01282 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPP01282 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPP01282 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIPP01282 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPP01282 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPP01282 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPP01282 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPP01282 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VIPP01282 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPP01282 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPP01282 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPP01282 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPP01282 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPP01282 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPP01282 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPP01282 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPP01282 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPP01282 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.9 ms