Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3BO95985 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3BO95985 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms