Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1PR4O95977 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR4O95977 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms