Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRUB2O95900 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRUB2O95900 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRUB2O95900 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRUB2O95900 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms