Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN5O94779 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN5O94779 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN5O94779 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN5O94779 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN5O94779 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN5O94779 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN5O94779 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN5O94779 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN5O94779 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN5O94779 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1168.6 ms