Protein–RNA interactions for Protein: O15234

CASC3, Protein CASC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3O15234 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC3O15234 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC3O15234 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC3O15234 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC3O15234 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASC3O15234 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASC3O15234 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASC3O15234 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CASC3O15234 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASC3O15234 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASC3O15234 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASC3O15234 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASC3O15234 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC3O15234 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC3O15234 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC3O15234 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC3O15234 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC3O15234 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC3O15234 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC3O15234 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC3O15234 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC3O15234 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC3O15234 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC3O15234 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC3O15234 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC3O15234 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC3O15234 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASC3O15234 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASC3O15234 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASC3O15234 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASC3O15234 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASC3O15234 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC3O15234 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC3O15234 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC3O15234 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC3O15234 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC3O15234 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC3O15234 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC3O15234 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC3O15234 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC3O15234 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC3O15234 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC3O15234 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC3O15234 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC3O15234 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC3O15234 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC3O15234 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC3O15234 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC3O15234 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC3O15234 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CASC3O15234 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASC3O15234 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASC3O15234 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASC3O15234 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASC3O15234 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASC3O15234 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CASC3O15234 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASC3O15234 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC3O15234 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC3O15234 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC3O15234 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC3O15234 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC3O15234 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC3O15234 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC3O15234 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC3O15234 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC3O15234 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC3O15234 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC3O15234 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC3O15234 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC3O15234 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC3O15234 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC3O15234 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC3O15234 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASC3O15234 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASC3O15234 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASC3O15234 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASC3O15234 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASC3O15234 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASC3O15234 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASC3O15234 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASC3O15234 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASC3O15234 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASC3O15234 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASC3O15234 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASC3O15234 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASC3O15234 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASC3O15234 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASC3O15234 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms