Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN9O14815 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPN9O14815 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms