Protein–RNA interactions for Protein: O14649

KCNK3, Potassium channel subfamily K member 3, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3O14649 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK3O14649 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK3O14649 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK3O14649 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK3O14649 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK3O14649 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK3O14649 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK3O14649 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNK3O14649 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNK3O14649 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNK3O14649 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNK3O14649 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNK3O14649 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNK3O14649 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304.5 ms