Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXN3O00409 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN3O00409 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXN3O00409 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXN3O00409 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXN3O00409 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXN3O00409 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXN3O00409 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms