Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3FO00303 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3FO00303 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms