Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DFFAO00273 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFFAO00273 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFFAO00273 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFFAO00273 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFFAO00273 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DFFAO00273 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFFAO00273 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFFAO00273 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DFFAO00273 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DFFAO00273 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DFFAO00273 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DFFAO00273 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFFAO00273 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFFAO00273 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFFAO00273 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFFAO00273 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFFAO00273 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFFAO00273 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFFAO00273 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFFAO00273 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DFFAO00273 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFFAO00273 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFFAO00273 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFFAO00273 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFFAO00273 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFFAO00273 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DFFAO00273 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DFFAO00273 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DFFAO00273 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DFFAO00273 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DFFAO00273 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DFFAO00273 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DFFAO00273 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DFFAO00273 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DFFAO00273 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DFFAO00273 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
DFFAO00273 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DFFAO00273 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DFFAO00273 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DFFAO00273 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DFFAO00273 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DFFAO00273 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DFFAO00273 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DFFAO00273 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DFFAO00273 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DFFAO00273 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DFFAO00273 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DFFAO00273 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DFFAO00273 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DFFAO00273 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DFFAO00273 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DFFAO00273 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFFAO00273 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFFAO00273 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFFAO00273 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFFAO00273 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DFFAO00273 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFFAO00273 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DFFAO00273 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DFFAO00273 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DFFAO00273 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DFFAO00273 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DFFAO00273 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DFFAO00273 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DFFAO00273 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DFFAO00273 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DFFAO00273 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DFFAO00273 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DFFAO00273 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DFFAO00273 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DFFAO00273 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DFFAO00273 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DFFAO00273 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DFFAO00273 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DFFAO00273 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DFFAO00273 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DFFAO00273 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DFFAO00273 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DFFAO00273 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DFFAO00273 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DFFAO00273 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DFFAO00273 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DFFAO00273 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DFFAO00273 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DFFAO00273 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DFFAO00273 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DFFAO00273 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DFFAO00273 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DFFAO00273 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DFFAO00273 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DFFAO00273 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DFFAO00273 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DFFAO00273 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DFFAO00273 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DFFAO00273 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DFFAO00273 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DFFAO00273 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DFFAO00273 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DFFAO00273 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms