Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMD12O00232 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD12O00232 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.7 ms