Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC188H7C350 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC188H7C350 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms