Protein–RNA interactions for Protein: B9A014

C21orf140, Uncharacterized protein C21orf140, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf140B9A014 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf140B9A014 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C21orf140B9A014 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf140B9A014 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms