Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM25AB3EWG3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms