Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB1P1B2RPK0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms