Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SMIM23A6NLE4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM23A6NLE4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms