Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRBC2A0A5B9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBC2A0A5B9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBC2A0A5B9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms