Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms