Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U3KQA8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
U3KQA8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQA8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQA8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQA8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQA8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQA8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQA8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQA8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQA8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U3KQA8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U3KQA8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U3KQA8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U3KQA8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQA8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQA8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQA8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQA8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQA8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQA8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQA8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQA8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQA8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
U3KQA8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U3KQA8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U3KQA8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQA8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQA8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQA8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQA8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQA8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQA8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQA8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQA8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQA8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
U3KQA8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
U3KQA8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
U3KQA8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U3KQA8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U3KQA8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
U3KQA8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U3KQA8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
U3KQA8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
U3KQA8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQA8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQA8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQA8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQA8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQA8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQA8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQA8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQA8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQA8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQA8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQA8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQA8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQA8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQA8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQA8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQA8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQA8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQA8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQA8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQA8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQA8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQA8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQA8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQA8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U3KQA8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U3KQA8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U3KQA8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U3KQA8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
U3KQA8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U3KQA8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U3KQA8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U3KQA8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
U3KQA8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U3KQA8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQA8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQA8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQA8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQA8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQA8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQA8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQA8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQA8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQA8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQA8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
U3KQA8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U3KQA8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
U3KQA8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
U3KQA8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U3KQA8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U3KQA8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U3KQA8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U3KQA8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U3KQA8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U3KQA8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U3KQA8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms