Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPSEQ9Y251 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HPSEQ9Y251 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HPSEQ9Y251 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms