Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN8AQ9UQD0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN8AQ9UQD0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN8AQ9UQD0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms