Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN2Q9UL51 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCN2Q9UL51 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms