Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C4Q9UKN8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C4Q9UKN8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms