Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
TNIKQ9UKE5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
TNIKQ9UKE5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
TNIKQ9UKE5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TNIKQ9UKE5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms