Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD3Q9UJU5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXD3Q9UJU5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD3Q9UJU5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms